Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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