Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem248Q3TBN1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem248Q3TBN1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem248Q3TBN1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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