Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rhox4fQ2MDF8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms