Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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