Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ttc39dQ0VF76 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc39dQ0VF76 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Ttc39dQ0VF76 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc39dQ0VF76 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms