Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb8Q0VBD0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itgb8Q0VBD0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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