Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms