Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms