Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms