Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdx4Q07424 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms