Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPINDOCQ05AH6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms