Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apoc2Q05020 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms