Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnd1Q03719 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnd1Q03719 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms