Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AlkP97793 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AlkP97793 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AlkP97793 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AlkP97793 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AlkP97793 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlkP97793 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms