Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gata5P97489 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata5P97489 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms