Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bop1P97452 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms