Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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