Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgcgP82348 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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