Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms