Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct5P80316 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cct5P80316 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms