Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms