Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad1P70340 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad1P70340 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad1P70340 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms