Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hoxd13P70217 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd13P70217 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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