Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cplx1P63040 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms