Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms