Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms