Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ythdf1P59326 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ythdf1P59326 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms