Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm2P58774 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms