Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms