Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpdl3bP58242 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpdl3bP58242 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms