Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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