Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms