Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn18P56857 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cldn18P56857 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cldn18P56857 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn18P56857 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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