Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf5P56477 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms