Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtskP55097 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms