Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms