Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LtbrP50284 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms