Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms