Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtpreP49446 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms