Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms