Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms