Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CratP47934 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CratP47934 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CratP47934 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CratP47934 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CratP47934 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CratP47934 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CratP47934 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CratP47934 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CratP47934 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CratP47934 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CratP47934 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms