Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms