Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgavP43406 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgavP43406 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms