Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clec3bP43025 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec3bP43025 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms