Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfsf9P41274 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms