Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp4P35123 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp4P35123 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms