Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc11P31313 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms