Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cd28P31041 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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