Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hoxd10P28359 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Hoxd10P28359 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd10P28359 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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